PyPhyloGenomics是用于系统基因组学的一个软件包,开发者为Carlos Peña(电子邮件:)。PyPhyloGenomics是在Python v2.7中开发的,并且它的安装程序会尝试自动下载并安装所需的所有依赖项。您可以从以下链接下载PyPhyloGenomics的最新版本:

安装步骤

  1. 使用以下命令安装PyPhyloGenomics:

python setup.py build

python setup.py install

  1. 如果安装失败,您可以手动安装所需的依赖项:

pip install -r requirements/dev.txt

MUSCLE依赖项

为了使PyPhyloGenomics能够对齐序列,您必须安装MUSCLE。请从MUSCLE官网下载安装。如果您使用的是Windows系统,请确保MUSCLE已正确安装并配置。