hiCLIP揭示了Staufen 1识别的mRNA二级结构图谱，该软件包对由hiCLIP、mRNA-Seq和核糖体分析产生的高通量测序数据进行分析。数据分析总结如下：

  1. 高通量序列数据Fastq文件可从以下途径获得，访问代码如下：

  2. iCLIP和hiCLIP：E-MTAB-2937

  3. mRNA-Seq：E-MTAB-2940

  4. 核糖体分析：E-MTAB-2941

  5. 解复用库Fastq文件：对获得的Fastq文件进行解复用。

  6. 数据预处理：下载并解析gtf和fasta文件等数据进行分析。

  7. 映射：高通量测序读数，包括hiCLIP、核糖体分析和mRNA-Seq数据的映射。

  8. 数据分析：对高通量测序数据进行分析，生成图表并执行相关统计分析，作为手稿中的主要数字。

  9. 可视化：使用IGV进行混合读取的数据可视化，混合读取结果通过IGV进行查看和分析。

相关文件使用IGV进行了可视化。