SQL Server和MySQL在多个方面存在显著差异，主要体现在开源性、平台依赖性、性能优化、社区支持、功能特性、安全性、成本和生态系统等方面。MySQL作为开源数据库，以其在高并发读写操作中的优势和强大的社区支持，广泛应用于Web应用和需要高度定制的场景。其性能和扩展性使得它在处理大规模数据时表现出色，尤其适合需要低成本和灵活配置的项目。

SQL Server是微软的商业数据库管理系统，具有强大的事务处理和复杂查询能力，适用于企业级应用。其与微软技术栈的紧密集成，如与.NET、Windows Server的协作，使得它在企业环境中非常受欢迎。SQL Server提供全面的安全特性，并且能够处理大规模的数据仓库和分析任务，特别适合需要高安全性和复杂业务逻辑的场景。

MySQL在成本上具有优势，它是免费的开源软件，适合预算有限的项目。虽然SQL Server需要购买许可证，但它的高级功能和企业级支持使得它对大多数企业来说具有吸引力。根据项目的需求、预算以及技术栈的选择，用户可以决定使用MySQL还是SQL Server。选择合适的数据库系统将有助于提高应用的性能、可靠性以及长期的可扩展性。