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GeoTcgaData中有一个人类基因id转换函数:`id_conversion_vector()`,它支持的id种类非常多,同时与同类软件相比,它的转换率也非常高。此文档是对于这个软件包的使用介绍。

南方医科大学余光创教授(Y叔)所开发的ggtree是一个非常强大的进化树可视化R包,我们基于这个R包开发出了一个shiny App。此文档介绍了此App的获取地址和使用方式。

在日常数据处理中,我们可能会有这样的情况:即使看了函数的帮助文档, 仍然不能很好的使用这个函数。或者我们仅仅是对这个函数如何实现这样的复杂 功能感到好奇。这时候就需要查看这个函数的源代码。本文档包含了查看泛型函数源代码的方法

南方医科大学余光创教授（Y叔）所开发的ggtree是一个非常强大的进化树可视化R包，现在Github有一个有趣的shinyApp便是基于ggtree开发的。此zip文件包含了这个App的源代码以及示例数据。

TCGA的RNA-seq文件的geneid是ENSEMBL的RNAid，使用的时候常常需要转化成genesymbol。此文档介绍了id转换的方法

原始sra测序数据、基因组注释文件、基因组参考数据的下载，整理，以及RNA-seq分析软件：hisat2和stringtie的安装和使用，差异基因的获取