NSGA3与NSGA2的算法框架大致相同，只是在选择机制有所不同。NSGA2用拥挤距离对同非支配等级的个体进行选择（拥挤距离越大越好），而NSGA3用的是基于参考点的方法对个体进行选择。NSGA3采用基于参考点的方法就是为了解决在面对三个及其以上目标的多目标优化问题时，如果继续采用拥挤距离的话，算法的收敛性和多样性不好的问题（就是得到的解在非支配层上分布不均匀，这样会导致算法陷入局部最优）。