生物信息学常用shell命令.mht
将匹配abc的行删除
Sed–e“/abc/d”file
多种可能性的查找
egrep'GC(A|T|C|G)GGAATTGAACAG'http://baike.baidu.com/view/1057278.htm
批量……
ls*.tar|awk'{print"bsubtarxvf"$0}'|sh
ls*.gz|awk'{print"bsubgzip-d"$0}'|sh
ls*.gz|awk'{print"gzip-d"$0"&"}'|sh
Bowtie2
批量建库
ls*.fa|awk'{print"bsub-o%J.log-e
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