电力系统故障录波数据是分析电网故障的主要依据，录波数据压缩有益于减小数据存储容量和提高数据传输效率。针对电力故障录波数据的格式及构成特点，提出了一种基于傅里叶变换和小波包变换的数据压缩新算法。采用离散傅里叶变换对录波模拟量通道的B时段数据进行压缩和重构，根据重构误差判断该通道是否为故障通道；对故障通道的暂态扰动时段采用小波包变换进行压缩，对正常通道及故障通道的其他时段采用傅里叶变换进行压缩。大量录波文件的压缩结果和工程实际应用表明，所提算法可以同时获得很高的压缩率和压缩精度，具有广阔的应用前景。