论文研究 高等植物蛋白的保守免疫球蛋白结构域相似性
使用生物信息学工具在高等植物序列中搜索免疫球蛋白结构域相似性的痕迹,以寻找可能的早期系统发生结构关系。 通过17种选择程序以及使用JavaScript,PHP,Windows程序和CDD进行保守域搜索的抗冗余序列相关方法,对通过16种初次BLAST搜索获得的28万个序列ID进行了不同的处理。 所得的17组记录描述了1323个不同序列ID的保守结构域相似性,产生了一组下一代(最终组),其中包括49个包含优越(“不可辩驳”)保守免疫球蛋白结构域相似性的记录。 映射选定的集合及其子集,然后就免疫球蛋白相关的以及其他相互的域连接进行统计比较。 常见的保守结构域相似性列表首先涉及对植物和后生动物免疫重要
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