论文研究 RNA Seq和散装分离基因分析与高生长的相关基因
银杏的寿命很长,其生长相对较慢。 但是,对该物种中与生长相关的基因知之甚少。 我们通过在转录组水平上开发多态性分子标记,将mRNA测序(RNA-Seq)与大量分离子分析(BSA)结合起来,精细绘制重要的农艺性状基因。 在这项研究中,对银杏半同胞家族的高生长(GD)和低生长(BD)样品进行了转录组测序。 组装干净的读段后,检测到601个差异表达基因,其中513个被分配了功能注释。 单核苷酸多态性(SNP)分析鉴定出与GD和BD组中的119个基因相关的SNP; 这些基因中有58个带有注释。 与BD组相比,GD组中两个Homeobox-亮氨酸拉链蛋白基因上调。 因此,这些很可能与银杏的高生长有关。
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