双水平图神经网络 总览 此存储库包含用于药物相互作用预测的双层图神经网络的代码。 有关详细信息,请参阅我们的论文 用于药物相互作用预测的双层图神经网络。 白云生*,顾坚*,孙宜州,王伟。 ICML 2020图形表示学习及超越(GRL +)研讨会 。 模型 我们引入Bi-GNN建模生物链接预测任务,例如药物-药物相互作用(DDI)和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)。 以药物-药物相互作用为例,使用机器学习的现有方法要么仅利用药物之间的链接结构而不使用每个药物分子的图形表示,要么仅利用单个药物化合物的结构而不对高级DDI使用图形结构图形。 我们方法的关键思想是从根本上将数据视为双层图,其中最高