核心:用于读取和写入基因组数据的Python和C ++代码 源码
核 Nucleus是一个Python和C ++代码库,旨在使您可以轻松读取,写入和分析常见基因组文件格式(如SAM和VCF)的数据。 此外,Nucleus支持与TensorFlow机器学习框架的轻松集成,因为在消耗或产生基因组文件的任何地方,都可以使用TensorFlow tfrecords文件代替。 讲解 请查阅有关教程。 这是一本Python笔记本,真正展示了Nucleus在整合多种文件类型(BAM,VCF和Fasta)中的信息并将其转变为TensorFlow可用形式时的强大功能。 轮询 以下哪项最能增加您对Nucleus的使用? (单击一个选项以对其进行投票。) 安装 目前,核只适用于使
文件列表
核心:用于读取和写入基因组数据的Python和C ++代码
(预估有个388文件)
htslib.BUILD
9KB
protobuf.BUILD
48KB
.bazelrc
3KB
test_alternate_index.bam
8KB
malformed2.bed
232B
NA12878_small.bam
72KB
NA12878_small.bam.bai
5KB
5col.bed
19B
test_nist.b37_chr20_100kbp_at_10mb.bed
264B
malformed.bed
113B
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