cellxgene_VIP:使cellxgene能够以高分辨率SVGPNG格式生成小提琴堆叠的小提琴堆叠的条形图热图火山嵌入点轨迹密度2D密度sankey和双基
cellxgene VIP释放了数百万个细胞规模的交互式可视化,绘图和分析scRNA-seq数据的全部功能 自2009年首次进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)研究以来[1],迄今已发表了1050多个scRNA-seq研究。 至少有25项研究报道了200k或更多细胞的概况[2]。 最大的scRNA-seq研究报道了250万小鼠细胞[3]。 可以预见,在scRNA-seq研究中,细胞大小将增加500k或更多。 庞大的数据量给科学家,甚至是精通计算的专家,在可视化和交互式探索这样的大数据集方面带来了挑战。 Cellxgene [4]是最近的评估中推荐的领先的开源scRNA-Seq数据可视化
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cellxgene_VIP:使cellxgene能够以高分辨率SVGPNG格式生成小提琴,堆叠的小提琴,堆叠的条形图,热图,火山,嵌入,点,轨迹,密度,2D密度,sankey和双基因图。 它还执行差异基因表达分析,并提供命令行界面(CLI),供高级用户使用python和R执行分析
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