深变体 DeepVariant是一个基于深度学习的变体调用程序,它接受对齐的读取(BAM或CRAM格式),从中读取堆积图像张量,使用卷积神经网络对每个张量进行分类,最后将结果报告为标准VCF或gVCF文件。 DeepVariant支持二倍体生物中的种系变异调用。 或NGS(Illumina)数据。 PacBio HiFi数据,请参阅。 混合PacBio HiFi + Illumina WGS,请参阅。 牛津纳米Kong使用长期读取数据。 通过使用的GenapSys数据。 另请注意: 对于体型数据或基因型超过两个DNA拷贝的任何其他样品,DeepVariant将无法立即使用,因