堆树X HapTree-X是一种计算工具,可以分阶段各种下一代测序数据。 目前,它支持全基因组,全外显子组,10X基因组学和RNA序列数据。 它对RNA-seq数据特别有用,因为它可以利用等位基因失衡来获得更好的相位基因区域。 安装 HapTree-X二进制文件在下可用于Linux和macOS。 建筑 要从头开始构建HapTree-X,您将需要最新版本的和 (通常随LLVM一起提供)。 然后,发出make生成HapTree-X。 生成的二进制文件将位于build/haptreex 。 用法 基本用法是: haptreex -v [VCF file with variants to be