accelerator_design:促进者活动的测量和建模; 人工启动子设计与测试 源码
启动子设计 为“模型驱动的人工酵母启动子的生成”开发的代码和分析脚本(Kotopka BJ,Smolke CD。模型驱动的人工酵母启动子的生成。NatCommun。2020; 11(1):2113。)。 提交历史 提交a8dc340对应于BioRxiv预印本( )。 安装/设置 Python脚本是在Ubuntu 16.04(xenial)上使用Python 2.7运行的; R脚本(在“ Figures / RStudio”和“ Code”中)在Windows 10上使用R 3.5.1在RStudio 1.1.463中运行。有关Python的要求,请参见主目录中的“ requirements.
文件列表
accelerator_design:促进者活动的测量和建模; 人工启动子设计与测试
(预估有个212文件)
train_model_GPD.cfg
455B
build_table_align_GPD.cfg
1KB
assign_bins_miseq_GPD.cfg
791B
assign_bins_nextseq_GPD.cfg
815B
fit_means_GPD.cfg
1KB
evolution_test.cfg
1KB
train_model_ZEV.cfg
455B
assign_bins_miseq_ZEV.cfg
791B
build_table_align_ZEV.cfg
1KB
fit_means_ZEV.cfg
1KB
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