EToKi:与Enterobase相关的所有方法 源码
EToKi(Enterobase工具套件) 所有与Enterobase数据分析管道有关的方法。 安装: EToKi是在Python 2.7和Python 3.5中开发和测试的。 EToKi依赖于几个Python库: ete3 numba numpy pandas sklearn 可以使用pip安装所有库: pip install ete3 numba numpy pandas sklearn EToKi还针对不同的管道调用以下第三方程序: raxml fasttree rapidnj bbmap mmseqs ncbi-blast usearch spades megahit sam
文件列表
EToKi-master.zip
(预估有个76文件)
EToKi-master
externals
pilercr
2.14MB
kraken2
26B
minimap2
916KB
SimBac
110KB
samtools
22B
trf409.linux64
113KB
makeblastdb
33B
usearch
53B
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