pyphy 与NCBI分类法交互的Python库 这是博客文章的Python实现。 入门 这些说明将为您提供在本地计算机上运行并运行的项目的副本,以进行开发和测试。 先决条件 sqlite 准备后端数据库 注意:请定期执行此步骤,以了解NCBI分类标准。 从ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/taxonomy/下载taxdmp.zip并将其解压缩。 python prepyphy.py [ncbi_download_folder] [db_path] 此步骤将在pyphy.config中自动设置“ db_path”。 如果之后移动数据库,请不要忘记刷新pyphy.config中的db_path。 使用图书馆 建立数据库后,您可以通过以下方式将pyphy库导入Python代码中: import pyphy pyphy在NCBI分类法中提供了以下查询: 分