Resource:对2152个Ig seq数据集的大规模分析揭示了B细胞生物学和抗体库的关键特征 源码
资源资源 概述 该资料库包含所有与脚本结果(MS)中每个部分中的关键分析相关的脚本和初步统计信息“对2,152个Ig-seq数据集的大规模分析揭示了B细胞生物学和抗体库的关键特征” 。 这些分析可分为四类,包括基因使用,体细胞重组,体细胞超突变和公共克隆。 在以下各节中可以找到更多详细信息。 基因使用 基因使用概述量化(图2A) python geneUsageOverview_quantification.py V_input.txt V outDir 脚本geneUsageOverview_quantification.py实现了V / D / J基因使用的概述。 它包含三个参数,包括表格用法矩阵文件,基因类型和输出目录。 使用率矩阵文件的每一列表示一个样本,每一行代表一个基因片段。 用法矩阵文件如下所示, SRR8365312 ERR2567197 ERR1812302 IGH
文件列表
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Resource-main
figures
regional_mut_freq_bwt_age_groups_IGHG.png
47KB
all_to_all_comparison_heatmap.png
201KB
SHM_motif_mutation_profile.png
25KB
mut_freq_age_regression_IGHG.png
39KB
linear_model_scatter_plot_for_samples_more_than_10000_clones.png
37KB
V_accu_fraction_median_slope.png
18KB
Clonality_against_publicness_and_CDR3_length.png
89KB
SHM_positional_mutation_profile.png
219KB
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