modPhred modPhred是用于检测,注释和可视化来自原始ONT数据的DNA / RNA修饰的管道。 管道包括四个步骤/模块: 管道包括四个步骤/模块(): 1. modEncode :编码FastQ中的修改概率(mod_encode.py) 2. modAlign :在BAM中建立路线keepind修改信息(mod_align.py) 3. modReport提取RNA修饰信息(bedGraph)和QC报告(mod_report.py) 4. modAnalysis :绘制维恩图(mod_plot.py),共存修改(mod_correlation.py)和基于修改概要文件的基于读取的聚类(mod_cluster.py) 有关更多信息,请访问完整文档。 引文 手稿正在准备中。 直到预印本准备好为止,请引用此存储库。