immuneML:immunoML是用于自适应免疫受体库数据的机器学习分析的平台 源码
免疫ML immunoML是用于基于机器学习的自适应免疫受体和库(AIRR)的分析和分类的平台。 它支持对实验性B细胞和T细胞受体数据以及用于基准测试的合成数据进行分析。 在immuneML中,用户可以定义灵活的工作流,以支持不同的机器学习库(例如scikit-learn或PyTorch),对不同方法进行基准测试,大量数据特征报告,ML算法及其预测以及结果可视化。 此外,用户可以通过定义自己的数据表示,ML模型,报告和可视化来扩展平台。 有用的链接: 主要网站: : 文档: : Galaxy Web界面: : 安装 可以直接安装immuneML。 immuneML使用Python 3.7或3.8,我们建议使用这些Python版本之一在虚拟环境中安装immuneML。 有关更多详细说明(虚拟环境,故障排除,Docker,开发人员安装),请参阅。 使用pip安装 要安
文件列表
immuneML:immunoML是用于自适应免疫受体库数据的机器学习分析的平台
(预估有个814文件)
.gitignore
454B
Dockerfile
865B
.dockerignore
12B
ExploratoryAnalysis.html
5KB
HPOptimization.html
7KB
Simulation.html
5KB
DatasetExport.html
2KB
custom.css
2KB
AssessmentSplitDetails.html
7KB
Subsampling.html
3KB
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