tree_move_examples 源码
用于在树移动示例上测试UShER。 运行python makeTreeMoveTestExamples.py 来产生一组2个与给定示例相对应的fasta文件,其中一个文件的所有样本都位于初始树中,一个文件中的所有样本都将添加。 示例文件应遵循以下格式: 面积S1 m1,m2,m3 S2平方米S3 m1,m3,m4,m5 S4 m1,m2,m3,m5,m6 S5 m1,m3,m5,m6 S6 m1,m5,m6 S7 m5,m6 S8 m6 等,以?结尾的突变转换为代表参考或替代的IUPAC。 我一直遵循此协议: 首先,像上面的一样创建一个example
文件列表
tree_move_examples-main.zip
(预估有个21文件)
tree_move_examples-main
e16Final.nh
86B
e10Final.nh
50B
e16.nh
36B
e11Final.nh
75B
e17Final.nh
98B
empty.nh
5B
makeTreeMoveTestExamples.py
3KB
e10.nh
35B
e11.nh
35B
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