指标-CGM-ECC 合并了两个单独项目的工作(可以在以下位置找到初始合并之前的状态: : 和 ) 要收集结果,请在终端中运行以下命令: Rscript环境_设置.R 这将安装环境中未找到的所有必需的R软件包,并检查是否可以正确加载它们。它还会将占位符源距离文件写入input / processed /目录,如果您有要使用的源数据,则可以覆盖该占位符。 如果对样本数据运行此过程,请运行 Rscript prepare_inputs.R 否则,将您(正确格式化的)输入文件移动到inputs / processed /目录中。要运行以下文件,需要使用4个制表符分隔的文件:时间点1的群集分配文件,时间点2的群集分配文件,应变元数据文件和源距离文件(如果未提供,将使用占位符)。 如果使用了示例数据,并且运行了prepare_inputs.R ,您将获得以下示例中使用的文件。 Rscript