细菌ID 此回购包含使用卷积神经网络(CNN)识别病原细菌的拉曼光谱的演示。 该存储库改编自论文“使用拉曼光谱和深度学习快速识别病原细菌”中用于产生结果的代码库。 最好的起点是Jupyter笔记本电脑,该笔记本电脑已记录并带有注释,并且应立即使用。 我们提供了已在参考数据集上进行过训练的预训练模型。 要求 此存储库中的代码已经过以下软件版本的测试: 的Python 3.7.0 PyTorch 0.4.1 Scikit-学习0.20.0 脾气暴躁的1.15.1 Jupyter 5.0.0 Seaborn 0.9.0 Matplotlib 3.0.0 我们建议使用Anaconda Python发行版,该发行版可用于Windows,MacOS和Linux。 已使用每个软件包提供者的标准说明对所有必需软件包(上面列出的)的安装进行了测试。 一旦安装了Anaconda,则将所有要