methyl.O:差异甲基化区域分析 源码

注释,评分和可视化差异甲基化区域 文档和联系方式 介绍 在过去的几年中,新一代测序技术适应表观遗传学研究,彻底改变了研究DNA甲基化状态的能力。 尽管新技术的发展以及对表观基因组学的兴趣日益浓厚,但可用工具的面貌并未为注释提供广泛的可能性。 在这里,我们介绍了methyl.O,R软件包和专注于甲基化分析的在线工具。 尽管实用的用户界面使非生物信息用户受益,但R包允许经验丰富的人员执行甲基化分析,并对参数进行更深入的控制。 用户界面也可以通过R在本地运行,以方便进行初步分析并轻松可视化数据分布和甲基化的基因区域。 methyl.O结果的特殊性是受甲基化影响最大的基因的排名列表,根据可用数据库,该基因最涉及病理。 排名列表表明该基因应侧重于了解甲基化作用并考虑进行进一步分析。 此外,当提供表达谱时,methyl.O允许将转录组学与甲基化组进行比较,以更深入地了解所产生的表型。 基于Enrich