KGL_Gene:C ++种群基因组分析 源码
KGL_Gene C ++人口基因组比较工具包 该软件已获得MIT许可,您可以出于任何目的使用或修改代码的任何部分。 该软件按“原样”提供,没有任何形式的担保或保证。 使用Fasta / Gff3 / VCF文件分析基因组种群中插入/缺失(Indel)和单核苷酸多态性(SNP)变异的工具包。 该工具包专门用于分析由疟原虫恶性疟原虫产生的血细胞膜蛋白(stevor,rifin,var和cleft)突变。 已经对该生物进行了广泛的测试。 该软件还支持其他生物,包括智人(您),并已用于分析最新(2021年2月)的GRCh38.p13智人基因组变异数据库。 为了获得最佳性能,需要1TB ecc ram和100个执行线程。 现在,这种硬件要求在公司服务器或大型工作站上很常见 该软件当前位于GitHub存储库中: : 软件要求: 目标操作系统是Linux,并且已在运行Mint 20.04
文件列表
KGL_Gene:C ++种群基因组分析
(预估有个403文件)
kgl_properties.cpp
25KB
kgl_main.cc
310B
kel_optimize.cpp
19KB
edlib.cpp
62KB
kpl_likelihood.cpp
37KB
kpl_tree_io.cpp
26KB
kpl_model.cpp
20KB
kpl_treemanip.cpp
28KB
kpl_strom.cpp
31KB
kgl_sequence_offset.cpp
27KB
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