转录调控网络是生物体遗传信息传递的整体表示,是人们理解基因表达过程的重要内容。识别转录调控网络的模块和模体是分析网络拓扑结构和组织方式的重要方法,是揭示转录调控机制和生物发育、进化过程的重要环节之一。通过分析比较近年来用于转录调控网络模块识别的三类典型算法,阐述了它们各自的优势和不足;介绍了一种被广泛使用的转录调控网络模体识别算法。以此为基础,提出了转录调控网络模块和模体识别算法的未来研究方向。