针对在生物信息网络中对复杂和大规模的数据集进行挖掘时所出现的算法挖掘精度低、运行速度慢、内存占用大等问题，提出一种基于关联规则映射的生物信息网络多维数据挖掘算法。该算法结合网络数据集之间的关联映射关系，从而确定网络数据集的关联规则，并引入挖掘因子和相对误差来提高算法的挖掘精度；根据多维子空间中数据集之间的关联程度进行子空间区分以及子空间内数据集区分，从而实现对不同数据集的有效挖掘。在实验中，对不同数据集数量下的算法内存占用情况、算法挖掘精度、算法运行时间进行仿真，从实验结果可以看出基于关联规则映射的挖掘算法可以有效地提高挖掘精度，在减少内存占用和提升计算速度上也具有一定的优势。