DNA编码序列的设计是影响DNA计算可靠性的重要途径，从DNA编码应满足的多约束条件中选取适当的约束条件，针对这些约束条件提出每个DNA个体应满足的评估公式以及目标序列集合的评价函数，采用文化进化粒子群算法解决DNA序列设计的多目标优化问题，仿真结果表明该混合算法针对DNA序列设计问题，在求解最优值能力，解的稳定性方面都取得了不错的效果。