实验四 基于CLUSTAL算法的多重序列比对分析.doc

基于C语言的广工大四高级算法实验，广工计算机科学与技术专业专用

为优化生物多序列比对问题,降低计算难度,提高计算效率,采用遗传算法模拟多序列比对,构造了四种简单的交叉算子及三种后处理方式,分析交叉算子和交叉后处理方式对多序列比对结果的影响。通过实验比较,结果表明多

实验四链路状态路由算法原理实验报告 【实验目的】 1、要求实验者利用路由选择算法模拟软件提供的通信功能，模拟链路状态路由选择算法的初始化、路由信息扩散过程和路由计算方法； 2、掌握链路状态算法的

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中介变量的使用和检验是管理研究中的主流趋势。介绍了一种分析中介效应的新方法——基于bootstrap 的结构方程模型分析，该方法可以克服逐步检验法和 Sobel 检验法在处理小样本量，小中介效应值，或

绍了四相序列扩频调制与解调方法,并对四相序列扩频与QPSK在高斯白噪声信道条件下进行了仿真。仿真结果表明,该方案与传统的多进制正交扩频系统相比,大幅提高了数据的传输速率和抗干扰能力,可以较好地适用于高

针对应用遗传算法求解生物多序列比对问题的初始化进行了改进.初始种群是遗传算法构造的一个关键部分,本文根据多序列比对的生物特性,在初始种群中的个体中插入连续空位,优化初始种群的个体质量;并在初始种群中加

提出一种基于Dijkstra算法的序列比对方法，该算法主要用于求最短路径，而序列比对可以转化为在有向无环图中寻找最短路径问题。对于少量序列比对，使用该算法可以求出最优解。对于多序列比对，可将在N维空间

采用多重分形谱对蛋白质序列进行分析。按照SCOP分类法，从PDB中选取三条同属于类的分维相近的蛋白质序列，利用多重分形分别对蛋白质空间距离以及序列中氨基酸的极性、体积的复杂性进行比较。实验结果表明，多

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