采用多重分形谱对蛋白质序列进行分析。按照SCOP分类法，从PDB中选取三条同属于类的分维相近的蛋白质序列，利用多重分形分别对蛋白质空间距离以及序列中氨基酸的极性、体积的复杂性进行比较。实验结果表明，多重分形的奇异谱函数比简单的分形维数能提供更多的信息，克服了分形维数相同情况下，精细结构无法区分的困难，分析结果能够更加准确地描述个体之间的差异。