双序列比对的基础(2)之替换(计分)矩阵系列
双序列比对的基础(2)之替换(计分)矩阵系列 主要以BLOSUM矩阵与PAM矩阵的介绍为主。 声明:该部分书中内容介绍有点少,所以我上网搜索到几篇文献和和国外大学的相关课件(从一个研究生博主处获得)。 那本篇文章就先介绍BLOSUM矩阵吧 BLOck SUBstitution Matrix:BLOSUM矩阵。 详细的来说,它们来自一组蛋白质家族中联配上的无空位区域,这些蛋白家族源于BLOCKS数据库。1 BLOSUM62矩阵广泛应用于双序列比对,也是BLAST程序默认调用的计分矩阵。 62是什么意思嘞? BLOSUM62 is derived from Blocks contai
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