世博 基于能源的Windows构建 什么是牛 COWBOE是用于伞采样中参数选择的python 3工具,这是一种用于分子动力学模拟的自由能计算方法。 特征 这是一个Python 3模块,因此易于安装。 完成了参数选择,该参数调整了窗口总数和用于伞采样的力常数。 使用Nelder-mead /受限Nelder-Mead单纯形优化算法对参数进行优化。 可以跟踪优化进度。 该模块包括用于比较和可视化不同PMF(平均力的潜力/自由能文件)和NM算法结果的功能。 安装 cowboe requires Python V3.6 or higher to run. 创建虚拟环境 最好将牛仔布安装在新环境中 使用venv对于Linux / macOS, python3 -m venv /path/to/new/virtual/environment source < venv> /bin/ac