proteomics:蛋白质组学分析工具
Saito Lab：计算蛋白质组学工具该存储库包含一组用于分析蛋白质组学数据的计算工具。一般系统说明这些工具帮助研究人员回答有关蛋白质组学数据的问题。这些工具帮助提供答案的一些具体问题包括：蛋白质组A和蛋白质组B中是否存在胰蛋白酶肽XXX？蛋白质组A和蛋白质组B共有多少种胰蛋白酶肽？蛋白质组A中是否都发现了胰蛋白酶肽XXX和YYY？蛋白质组A中有多少与肽XXX相差n个位置的胰蛋白酶肽？
分析工具包括： 1) 一个数据库，存储在一个独立的SQLite文件中。 2) python库，用于处理、摄取和分析数据3) 命令行脚本，充当python库和数据库的接口。请注意，这并非设计为高性能/大容量解决方案；相反，它用作对蛋白质组学数据进行计算分析的快速简便的测试平台。安装这些说明假设您在具有pyth。
更多关于蛋白质组学数据分析的信息，可以参考以下资源：
蛋白质组学色谱质谱技术及其数据处理
mztools蛋白质组学和质谱分析工具集源码
mmtf蛋白质组学在3D蛋白质结构上映射蛋白质组学数据的方法源码
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pwiz ProteoWizard库是用于快速开发质谱和蛋白质组学数据分析软件的一组软件库和工具源码
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膀胱癌尿液蛋白质组学质谱研究方法
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