针对已有克隆代码检测工具只输出克隆组形式的检测结果，而难以分析克隆代码对软件质量的影响问题，提出了危害软件质量的关键克隆代码的识别方法。定义了克隆代码的统一表示形式，使之可以分析各种克隆检测工具的检测结果，然后解析源程序和克隆检测结果，识别标志符命名不一致性潜在缺陷，定义了克隆关联图，在此基础上检测跨越多个实现不同功能的文件、危害软件可维护性的克隆代码，最后对检测结果进行可视化统计分析。克隆代码分析工具被应用于分析开源代码httpd，检测出了1组标志符命名不一致的克隆代码和44组危害软件可维护性的关键克隆类。实验结果表明，该方法可以有效辅助软件开发和维护人员分析、维护克隆代码。