OmicSelector OmicSelector是一个环境,基于Docker的Web应用程序和R包,用于从高通量实验等中进行生物标记签名选择(功能选择)。 它最初是为miRNA-seq(小RNA,smRNA-seq;因此更名为miRNAselector),RNA-seq和qPCR开发的,但可用于应选择数字特征以抵消模型过度拟合的每个问题。 例如,使用我们的工具,您可以选择具有最大诊断潜力的miRNA(基于miRNA-seq的结果,用于qPCR实验中的验证)。 OmicSelector的主要目的是为您提供一组候选特征(生物标记),以进一步验证来自例如高通量实验的生物标记研究。 程序包首先执行功能选择。 在下一步中,将在称为“基准测试”的过程中测试功能集。 在基准测试中,我们使用各种数据挖掘(机器学习)方法测试所有这些功能集(生物标记)。 根据交叉验证或保持验证(测试集和/或验证集上的测