颜色分类leetcode DeepCC:一种新的基于深度学习的癌症分子亚型分类框架

壁虎 1 0 zip 2024-10-06 03:10:42

颜色分类leetcode深度CC DeepCC:一种新的基于深度学习的癌症分子亚型分类框架。更新添加了对使用keras框架进行深度学习的支持,修改了深度网络架构以获得更好的性能。依赖关系:当前版本的DeepCC依赖于keras框架,支持CPU和GPU。请先按照说明安装在R中,并确保keras能够正确运行。

安装:您可以使用devtools直接从GitHub安装DeepCC。


install.packages(\"devtools\")

devtools::install_github(\"CityUHK-CompBio/DeepCC\")

或者:


install.packages(\"remote\")

remotes::install_github(\"CityUHK-CompBio/DeepCC\")

快速开始:作为案例研究,您可以从CRCSC的存储库中获取组织良好的结直肠癌数据。DeepCC只需要两个输入即可启动:一个包含基因表达谱的数据框(每一行代表一个患者样本,列名应该是基因的Entrez标识符),以及包含训练标签的字符向量。

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